Estudio genético en pacientes con hipoacusia de la Comunidad Valenciana

Abstract

La pérdida de audición es uno de los defectos sensoriales más comunes en humanos. Puede deberse a factores ambientales, causas genéticas, o a una combinación de ambos. La hipoacusia hereditaria se puede clasificar como sindrómica y no-sindrómica, siendo esta última responsable del 70% de los casos. Se han identificado más de 100 genes y más de mil mutaciones implicadas en esta patología, por lo que presenta una gran heterogeneidad genética. En este trabajo se pretende evaluar la eficiencia diagnóstica de un panel de secuenciación, de diseño propio, por Next Generation Sequencing (NGS) para el análisis de pacientes con hipoacusia neurosensorial. En este estudio participaron 37 pacientes del Hospital Universitario y Politécnico La Fe (Valencia) a lo largo del 2019, a los cuales se les realizó una secuenciación masiva mediante un panel de secuenciación NGS, con los 61 genes más prevalentes causantes de hipoacusia hereditaria. Con este panel se detectaron mutaciones puntuales patológicas o posiblemente patológicas, las cuales se confirmaron posteriormente por secuenciación Sanger. Además, se analizó la presencia de variantes en el número de copias (CNVs) de todas las muestras, ya que también pueden ser responsables de hipoacusia neurosensorial. Si había alguna variante candidata, esta se confirmaba por el método de MLPA. Se detectaron mutaciones que podrían considerarse como posibles causantes de hipoacusia neurosensorial en 19 pacientes. En 1 de estos casos se detectó una CNV. También se vio que las mutaciones más predominantes en los pacientes clasificados como positivos se localizan en los genes GJB2 y TECTA. En conclusión, se consiguió diagnosticar genéticamente un 52,78% de los pacientes. Finalmente, se realizó un informe con los resultados del análisis para informar a los pacientes, además de ofrecerles consejo genético.

Hearing loss is one of the most common sensory defects in humans. It can be caused by environmental factors, genetic causes, or a combination of both. Hereditary hearing loss can be classified as syndromic and non-syndromic, the latter being responsible for 70% of cases. More than 100 genes and more than a thousand mutations involved in this pathology have been identified, which is why it presents great genetic heterogeneity. This work aims to evaluate the diagnostic efficiency of a sequencing panel, of our own design, by Next Generation Sequencing (NGS) for the analysis of patients with sensorineural hearing loss. In this study, 37 patients from La Fe University and Polytechnic Hospital (Valencia) participated in 2019, who underwent massive sequencing using an NGS sequencing panel, with the 61 most prevalent genes causing hereditary hearing loss. With this panel, pathological or possibly pathological point mutations were detected, which were subsequently confirmed by Sanger sequencing. In addition, the presence of copy number variants (CNVs) of all samples was analyzed, since they may also be responsible for sensorineural hearing loss. If there was any candidate variant, it was confirmed by the MLPA method. Mutations that could be considered as possible causes of sensorineural hearing loss were detected in 19 patients. In 1 of these cases, a CNV was detected. It was also found that the most predominant mutations in patients classified as positive are located in the GJB2 and TECTA genes. In conclusion, it was possible to genetically diagnose 52.78% of the patients. Finally, a report was made with the results of the analysis to inform patients, in addition to offering them genetic counseling.